Fontes desta página: Serebii e Bulbapedia
- Nome: Yveltal (exclusivo de Y) e Xerneas (exclusivo de X).
- Onde encontrar: Team Flare HQ, durante a história do jogo.
- Dificuldade para capturar: Baixa
- Nível: Ambos no level 50
- Ataques: Xerneas - Gravity, Geomancy, Moonblast e Megahorn/ Yveltal - Snarl, Oblivion Wing, Disable e Dark Pulse.
- Habilidade: Xerneas - Fairy Aura/ Yveltal - Dark Aura
- Nome: Zygarde
- Onde encontrar: Terminus Cave (após derrotar a E4)
- Dificuldade para capturar: Alta
- Nível: 70
- Ataques: Crunch, Earthquake, Camouflage e Dragon Pulse.
- Habilidade: Aura Break
- Nome: Mewtwo
- Onde encontrar: Pokémon Village - Caverna (após derrotar a E4)
- Dificuldade para capturar: Alta
- Nível: 70
- Ataques: Recover, Psychic, Barrier e Aure Sphere.
- Habilidade: Pressure
Zapdos, Moltres e Articuno. Após derrotar a E4, existirá a possibilidade de encontrá-los no mar ou na terra de Kalos. Porém, só será possível capturar um deles em cada versão. Se você escolheu Chespin, Articuno será o disponível. Se pegou Fennekin, Zapdos dará as caras. E por último, se pegou Froakie, Moltres irá aparecer. Eles irão fugir do combate após você fazer o primeiro movimento, assim como foi com Mesprit e Cresselia em DP, por exemplo. Depois de você encontrar eles muitas vezes, entre 6 e 12 vezes, eles irão se direcionar para o Sea Spirit Den, onde será possível fazer um combate de igual a igual com eles. Ambos estarão no nível 70, com a habilidade Pressure.